第1集：颜书仁与孙树分手 孙树母亲突发疾病
心理医生和病人虽然是医患关系，其实两者之间本质没有区别，都会经历生老病死，面对人生各种黑暗…….
从小父母离异的精神病医生颜书仁也有不为人知的心病，三年前，他与主修心理科的女友孙树分手了。自己的感情遇到挫折，颜书仁顾不上自我治疗，而是引导一个感情失意的女子走出心魔直面自己。女子在颜书仁的引导下发泄负面情绪，敲打穿着衣服的假人，见到了前男友。她没有再仇视前男友，选择忘记前男友。
孙树在日本进修多年，获得在日本工作的美籍华人弗兰克仰慕，弗兰克邀请孙树吃饭，孙树顺带叫一起在日本留学的好友邹华叫来参加饭局，三人一边吃饭一边谈天说地，气氛愉快融洽。
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陈一凡研究分析颜书仁的行踪，当年两人跟一帮好友下乡，到一幢老宅里面拍照玩耍，陈一凡推测颜书仁去了乡下老宅，立即把这一消息告诉给了孙树。孙树接到电话喜出望外，决定跟陈一凡下乡去找颜书仁。出发之前，她与母亲拥抱，感谢母亲特地上门陪伴多日，如果没有母亲陪伴开导，她不敢想象自己如何承受来自时间的煎熬。
陈一凡驾车带领孙树来到乡下，颜书仁躲在院子里面，紧闭大门，如同他的心一样，紧紧关闭，拒绝任何外人闯入。孙树隔门开导颜书仁，试图打开颜书仁关上的心门。在她的劝说声中，颜书仁情绪失控失声痛哭，想起了自己曾在桥上发誓永远爱孙树的情景，这份誓言也许实现不了，他觉得自己无法给予孙树该有的幸福。很多人看起来坚强，其实是因为没有再次直面曾经遭受过的痛苦，一旦再次深陷其中，将会彻底崩溃。颜书仁便是如此，他把母亲逝世的痛苦深埋心中，利用时间冲淡回忆带来的伤痛，一步一步治愈自己。谁料跟母亲车祸有关的证人刘翠芬出现了，逼得他再次直面不敢面对的痛苦，迅速击垮了他。
孙树放了一个随身听在门外，回到车上。颜书仁经历了一晚上的煎熬，打开了大门，如同打开了自我封闭的心门。他跨出了大门，捡起放在地上的随身听，插了一只耳塞到耳朵里面，播放音乐，感觉又回到了与孙树在大学时代恋爱的时光。当年孙树与颜书仁甜蜜相恋，两人最喜欢一起戴耳机共享音乐。音乐不但可以让人身心愉悦，也能解开人的心结，颜书仁听着音乐，眉目渐渐舒展，走到车外，笑容满面向坐在车内的孙树递上一只耳塞。他曾经数次梦到自己被孙树抛弃了，但他发现自己在现实生活中一直没有被孙树抛弃，这是他的心魔在作怪。
陈一凡找到颜书仁的消息传回医院，景然激动难抑向张继承等人报喜。卢主任从拐角处走出来，听着景然宣布找到颜书仁的好消息，脸上升起一丝欣慰，没有参与到下属们的欢乐中，默不作声转身离去。
好兄弟已经找到，陈一凡回归到岗位上，开始着手处理小铃噹做手术的事情。小铃噹的颅骨先天发育不良，脑袋顶部隆起一个大包，影响了外在形象。陈一凡决定为小铃噹做颅骨修整手术，该手术耗时很长，费用巨大，刘翠芬经济条件一般，没有能力承受高额的手术费用。陈一凡看出了刘翠芬心中的苦恼，提醒刘翠芬大可放心让儿子小铃噹做手术。他已经与相关部门联系，小铃噹的手术费用由相关部门承担。
第40集：大结局：颜书仁治愈心结 孙树与颜书仁游日本
颜书仁与孙树在乡下老宅居住，两人过上了无忧无虑的日子，孙树俨然当家作主的女主人，照顾颜书仁的起居饮食。颜书仁坐享其成，每天吃饭睡觉，衣来伸手，饭来张口，如同古时的老爷。 陈一凡上门看望颜书仁，兄弟相见，一切尽在不言中，两人紧紧搂在一起，许久不分开。孙树为了治愈颜书仁的心病，招呼也不打一声，叫来了刘翠芬。颜书仁见到刘翠芬的那一刻，脸上的笑容瞬间凝固，刘翠芬的出现，又一次把他拉回到了痛苦的深渊中。刘翠芬满脸愧疚重提颜母当年出车祸真相，官方事后公布处理结果，认定颜母死于自杀。刘翠芬否认了官方的调查，向颜书仁讲述颜母被汽车撞死的经过。颜书仁一直认定母亲不是自杀，刘翠芬也证实了他的猜测是正确的，这是一份迟到的真相，他等这一天等得太久了。其实，摆脱痛苦的最好办法就是直面痛苦，颜书仁直面了带给他痛苦的刘翠芬，解开了心结，带领孙树返回多年以来一直不敢踏足的老房子，直面父母的遗相，扫视尘封的家具，打量每个角落，勇敢面对曾经不敢面对的一切。
孙树回医院上班，有感而发向陈院长自我检讨。当初颜书仁失踪，孙树焦急不安，急于求成，只想见到颜书仁，说一堆道理强行开导颜书仁。直到与颜书仁在乡下老宅住了一段时间，她才意识到自己做事操之过急，欲速则不达。面对像颜书仁这样的心理疾病患者，不能一股脑儿实施治疗手段，应该有个过程，一步一步循序渐进，于无声中渐渐打开患者的心结。有了亲身经历，孙树对自己的职业有了更深的感悟。韩小鹿多次怀孕，再一次怀上了孩子，孙树以过来人的身份指导韩小鹿，提醒韩小鹿怀上孩子也不能太心急，要慢慢地孕育肚中的小生命，就跟润物无声一样，不能操之过急。
人不是机器，需要休息。陈一凡请了长假，叮嘱颜书仁好好照顾孙树，生命何其短暂，陈一凡决定去北极旅游，开阔自己的眼界。每个人似乎都找到了自己的生活方向，孙树晚上与丽莎见面，谈各自的生活，丽莎经常抽时间去福利院做义工，她觉得自己过得很踏实，人生开始变得有意义了。
一年后，颜书仁携孙树游日本，两人到了日本后光顾了一家料理店，颜书仁向孙树透露了一个秘密，当年与孙树分手后，他曾经去日本寻找孙树，在如今光顾的料理店意外见到了孙树。由于担心孙树已为人母，他不敢上前向孙树打招呼。原来，多年以前两人就在料理店相遇，只是没有正式面对彼此。颜书仁为孙树画了一幅画，画中的孙树面带笑容拥抱仙人掌。生活其实跟仙人掌一样，带了很多刺，只要勇敢拥抱生活，就会发现它其实没那么可怕。