第1集

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第19集

萨帕塔看利瓦伊的报道时，看到了全球大学生橄榄球赛，想起了纹身上的那些数字，于是去找帕特森解文字之谜。利瓦伊是哈德森大学的跑卫，因吸毒被逐出球队，而那些数字正好是哈德森橄榄球队全盛时期四次获胜的比分。帕特森调查了哈德森大学，发现学校去年因诈骗奖学金接受了联赛的调查，几周后首席调查员艾德声称奖学金系统没有问题，而六个月后艾德便成为了大型运动服装公司的副总裁，此刻正被审查。现任的哈德森大学校长是凯伦，里德又正好认识学校里的防卫教练，所以柯特他们首先去找教练了解一下学校的情况，可没想到凯伦却出面阻拦他们的谈话。就在帕特森准备通知柯特他们，她的新发现之时，信号突然中断了，而此时有人从教室里跑出来，声称有人持枪让大家离开，柯特他们只好先闯进去看看。学校里一片混乱，信号全部被中断，连座机通讯也被切断了，柯特他们只有分开来一层一层查找持枪者。萨帕塔在食堂寻找持枪者时，正好遇到持枪者追杀着教练而来，还打中了教练的腿。萨帕塔在持枪者离开之后，用皮带绑住了教练的伤口之后，便扶着他想要通过礼堂找出口，可没想到还是被持枪者找到了，萨帕塔带着教练躲在那里，打到枪没有子弹。简发现尸体，便跟着尸体进了篮球场，可没想到却被那里的保安当成持枪嫌疑人，简只好夺了他的枪，告诉他自己是FBI的人，然后再跟他一起合作去找持枪者。简跟随枪声到了食堂，发现了被打中流血不止的凯伦，她只能用烫红的铁勺烙伤口，暂时处理了凯伦的伤口，然后将她交给保安。在礼堂里枪声一直响个不停，简冲了进去，才杀死了一直在那里寻找萨帕塔的持枪者，阻止他继续开枪。留萨帕塔照顾教练之后，简继续去寻找持枪者，正好与柯特撞上了，因为尸体越来越多，让他们不得不扩大搜索范围。柯特在寻找持枪者之时，发现学校里藏有大量的炸弹，他破窗从另外一间教室爬过去，结果发现炸弹就拴在门上，而此时又有几名向他走来，他只好将学校带走之后，再重新返回。柯特返回之时，看到拿枪在推门的利瓦伊，逼着利瓦伊放下武器，可没想到利瓦伊扔掉了一支长枪，还有一把手枪，不停地朝柯特开枪，而此时炸弹被引爆了。其中一名持枪者被捕，柯特看着利瓦伊逃跑，随后他才与简他们会合了，而唯独里德还不知道下落。搜出了持枪者身上的干扰器之后，柯特他们恢复了通讯，与梅菲尔联系上了，并将学校遭袭击的事情向梅菲尔汇报。里德带着学生离开之时，不小心触碰了绑在门上的炸弹，他只得借薇乐莉的耳环，减小炸弹的威力，然后再引爆炸弹，可没想到炸弹响了之后，他被利瓦伊给挟持了。利瓦伊要求见教练，逼着里德带路，并将教练做的违法之事说出来。里德想劝利瓦伊放下武器，可利瓦伊不肯听劝，柯特只能击毙利瓦伊。从被抓的持枪者蒂姆口中，证实了利瓦伊所说的话，奖学金是学校给学生的封口费，而牵扯到学校上下不止教练还有校长，所以梅菲尔下令彻查。

第20集

奥斯卡给简第二个任务，让她将U盘插进FBI的电脑，复制一些他们需要的文件。简不知道这么做是否正确，也不知道是否应该完全相信奥斯卡，所以在离开之后偷偷跟踪了奥斯卡。博登在医院里碰到了一个奇怪的病人，她是一名小女孩，看起来没有健康问题，可就是不肯跟任何说话。博登去了解情况之时，发现小女孩手上的画，与简躺在的纹身有部分相似，便将这个线索交给了FBI。帕特森确认，小女孩画上的与纹身一致的图案，是叙利亚艾哈迈迪家族的标志，该家族管理着一个隐秘性极强高度组织化的恐怖主义组织。梅菲尔说明，他们收到线报，有三名该家族的管理人员进入了美国，肯定是准备执行恐怖袭击。梅菲尔找来了追踪艾哈迈迪家族多年的拉塞尔，又正好帕特森验出了小女孩的DNA，确认小女孩是艾哈迈迪家族的组织头目塔里克的女儿，名叫马娅。为了得知详情，马娅又患上了自闭症不肯开口，简只好用自己的纹身去跟马娅沟通，才让马娅把绘本给简。马娅的绘画本上有杰里米的头像，而杰里米又是一名记者，FBI认为马娅一定见过杰里米，或者杰里米帮助马亚一家潜入美国，所以柯特便把杰里米叫回来问话。杰里米不肯透露任何线索，而随后马娅又画出了另一由画，是一条街道，柯特他们只好去那里查看一番。在马娅的画里，柯特他们发现了马娅母亲内敏的尸体，因为内敏的死，杰里米才肯说出他与内敏认识的过程。杰里米要求柯特，利用他做诱饵，将想要杀内敏与马娅的人引出来，结果杰里米的出现真的引来了杀手。成功击毙杀手之后，帕特森确认那些人就是杀死内敏的人，所以FBI的下一步计划，便是找到那些进行恐怖袭击的人。博登建议，将马娅带到他乡下的一处房子里住下，认为那里能让马娅敞开心扉，FBI众人都同意了，拉塞尔也只能同意，并准备在接到马娅的外婆之后，也送到那里照顾马娅。梅菲尔联系上了马娅的外婆之后，才知道马娅的画是证据，会给马娅带来杀身之祸，梅菲尔只能马上通知柯特，将马娅带去安全屋。柯特和简出去买东西，里德联系博登之时已经联系不上了，他们只能全部往回赶，以确保能保证马娅的安全。博登和帕特森发现木屋停电之时已觉得异常，他们正想做好防备工作之时，发现马娅走出了木屋，而此时又正好看到敌人开车前来了，他们唯有先带马娅躲进木屋。刚解决了私闯木屋者，没想到又来了另一批敌人，帕特森只好用声东击西的办法，引开敌人的注意。柯特他们赶回之时，敌人已经出现了，他们只有尽量击毙外围的敌人，让帕特森他们可以偷偷地从房顶救出马娅，然后将木屋炸毁解决敌人。拉塞尔得知马娅被追杀，马上就想带走马娅，而马娅此时正好认出了拉塞尔手上的戒指，所以把她画的画交给博登看。博登看到画才知道，拉塞尔是找马娅的人，拉塞尔只好挟持博登反抗。马娅看到拉塞尔与柯特他们对峙，便打开车门袭击了拉塞尔，这才让柯特他们逮捕了拉塞尔。

第21集

为了警告梅菲尔不准她再查汤姆的事情，神秘人在亚历山拉德与梅菲尔见面之时，杀了亚历山拉德，并给予梅菲尔警告。马修前来收梅菲尔的东西时，与萨帕塔撞见，让梅菲尔一眼就看出他们之间早已相识，所以等马修离开之后就马上去质问萨帕塔。就在梅菲尔向萨帕塔质问之时，广播里突然通知在进行应急性系统测试，封锁了所有门让大家留在原地。帕特森与简正在练拳，本以来也只是演习，可看到手机没有了信号，让帕特森觉得或许不是演习，于是想进系统查看一番，结果被屏蔽了，她这才明白有人黑进了FBI的系统。帕特森和简通过空调槽，爬到了博登的诊疗室，与柯特会合，再通过线路打开了诊疗室的门。离开诊疗室之后，帕特森马上登入系统，发现他们的主服务器被人侵入，而侵入者正在下载FBI存储的卧底身份。帕特森上不了网，没办法阻止侵入者，她只有让柯特他们帮忙，让他们先恢复通讯系统。为了让系统以为有紧急情况，必须启动疏散程序，这样他们才有机会恢复正常，所以帕特森建议他们必须制造一场大火。帕特指挥，柯持与简去卫生间找来所有的纸，然后准备点火，可没想到火点着了却还没有触动感应器，柯特只能在火上焦油终于启动系统自动灭火。趁着灭火开门之时，柯特和简闯进了电讯室，然后切断所有线路，可下载程序还在进行，帕特森这才怀疑侵入者在本幢大楼里。侵入者在总机房里发现下载受到了阻拦，得知他们的行动被发现了，所以往电讯室放二氧化碳。电讯室里的空气，只够柯特他们呼吸一分钟，帕特森只能教柯特切断一条重要的红色通讯绳，然后让他们从空气槽爬出来逃生。被梅菲尔一直追问，萨帕塔终于将马修找她的实情告诉梅菲尔，表示是马修一直在调查梅菲尔，而她也看到了梅菲尔一直不正常的举动，所以受马修影响怀疑梅菲尔。马修告诉萨帕塔，所有在梅菲尔身边的人，最后都会离开，就像索尔、亚历山拉德他们一样，所以萨帕塔相信了马修的话。梅菲尔非常生气，认为萨帕塔既然有疑惑，为何不肯告诉她，为何又要留在不信任的领导身边。柯特和简逃了出来，带着梅菲尔他们冲到总机房逮捕入侵者时，入侵者正好下载完成了程序准备逃跑。两名入侵嫌疑人分开逃跑，其中一名嫌疑人被柯特他们击毙，而另一名嫌疑人逃跑。帕特森通过嫌疑人身上的证件，发现两名嫌疑人是卡洛斯和尼科尔，而此时卡洛斯正威胁要将电梯扔下，逼柯特他们交出尼科尔。帕特森试着控制所有电梯，让柯特和简去救人，而让梅菲尔和萨帕塔根据卡洛斯的信号去逮捕他。梅菲尔找到了卡洛斯，卡洛斯说明还有两分钟电梯就会降落，除非他输入密码，而柯特此时则分秒必争地救里德。萨帕塔为了让卡洛斯解密，把尼科已死的事情告诉他，可没想到卡洛斯却想与她们同归于尽，萨帕塔她们只好击毙卡洛斯。只剩下七秒的时间，里德刚够时间抓住柯特丢下的水管，电梯就掉了下去，里德很幸运地逃过了此劫。

第22集

简听到了马修对梅菲尔的审讯，得知所有种种的指控，都是她为奥斯卡所做的那些事，让马修变成了指控梅菲尔谋杀的证据。简生气地去找奥斯卡质问，并表示她不会再听奥斯卡的吩咐去做，索菲亚只好出面为奥斯卡证明，并说出他们要赶走梅菲尔的目的。梅菲尔被软禁在家中，柯特想帮她的忙，让她将白昼计划说出来，可梅菲尔不想冒这个险，让大批被抓的犯人被释放出来，坚持不肯为了澄清自己而说出白昼计划。柯特想帮梅菲尔找出索菲亚，证明梅菲尔的清白，梅菲尔明确告诉柯特，不要那样做也不要再提白昼计划。佩灵顿局长通知柯特，因为梅菲尔被逮捕了，他要暂停所有的案件，包括简的案件。柯特不管佩灵顿的警告，继续查他的案件，让帕特森汇报新的进展。一个市中心政府大楼的门卫，在大楼前发现了一个未标记的包裹，找到了一个刚出生24小时的婴儿，而婴儿的手臂上也有跟简一样的纹身。为了不让佩灵顿找麻烦，柯特将组员都带到了诊疗室里谈案情，分析将婴儿丢弃的凶手爱德华。在医院找到爱德华之时，爱德华非常内疚地想要说出实情，结果被狙击手给击毙了，而爱德华的身上也有一个跟简身上一样的纹身图案。帕特森查出，婴儿是布赖斯的儿子，可布赖斯却没有报警，让柯特他们很奇怪。柯特去找布赖斯，得到的答案却是，布赖斯没有出轨，而他们的孩子正得重病躺在家里。因为布赖斯一家人的身份，佩灵顿很快就知道了柯特他们上门的事情，又再次将柯特训斥了一顿，不准他们继续调查。帕特森再做一次DNA比对，发现婴儿的生母就是布赖斯的老婆翠西，这让柯特特别不明白，为何他们夫妻都不承认这个孩子的存在，还要演戏说他们只有一个儿子。简去医院之时，正好有一名女士冲进了医院大楼，公然抢走那个婴儿。柯特把翠西叫到了FBI，翠西于是向柯特他们坦白，她和布赖斯参与了彼得投资的医疗研究项目，并给他们提供了基因样本，而明天正是彼得告诉翠西他们，要对她的儿子进行第一次骨髓移植的时间。梅菲尔收到了朋友帮她搞定的那张奥斯卡照片，仔细回想了近期发生的事情，怀疑亚历山德拉被杀是一个圈套，索菲亚回来找她要钱也是圈套，所以她便按照索菲亚的习惯，去寻找索菲亚留下的线索，终于找到了索菲亚留下的一个手机号码。简通过挟持的其中一名闯医院的绑匪，找到了彼得的医疗机构实验室，发现了那些实验的婴儿，并救下了翠西的女儿。正当柯特他们找到实验室之时，简在婴儿房里袭击了彼得和他的打手，简为此差点被彼得的打手给打死。柯特冲进实验室，不仅救了简，还救下了那些无辜的婴儿。佩灵顿为柯特不执行他的命令批评柯特的时候，柯特并没有觉得自己做错了，认为他相信自己所相信的是非黑白。佩灵顿训斥完柯特之后，任命柯特为纽约办的局长，柯特不想接受这份任职，可佩灵顿丝毫不管他的意愿。简离开了FBI，向奥斯卡宣布一切结束之时，发现眼前的人并不是奥斯卡，而是梅菲尔。梅菲尔看到简，便认为是简陷害了她，所以持枪逼问简，结果被奥斯卡开枪打死。柯特的父亲弥留之际，告诉柯特，他杀了泰勒。

第23集

柯特不敢相信父亲临终前说的那句话，特意去找博登了解情况，博登只能告诉柯特，这得靠柯特自己分析，或许他父亲所说的就是一个真相。柯特联系不上简，不知道究竟简不是泰勒，他只能去找简，可简此时正在奥斯卡的家里，寻找奥斯卡的踪迹。艾莉到FBI了解梅菲尔的情况，想确定梅菲尔是否跟他们联系，里德他们虽然什么也没透露，却还是担心梅菲尔的情况，所以决定去给梅菲尔地址的那个地方瞧一瞧。柯特为了找到答案，只能前往父亲所说的那个木堡去看一下，想知道那里究竟有没有泰勒的尸体。简无法找到奥斯卡，只能凭借奥斯卡给她的中间人的号码，找角枭帮她追踪位置。简找到了中间人的房车，并潜伏在房车里等中间人出现，可没想到被中间人发现了，给房车里放毒气，逼简不得不从房车里跑出来。简被挟持，只能说出凯德再出现的事情，让中间人把奥斯卡的下落告诉她。里德和萨帕塔到了之后，并没有发现梅菲尔的尸体，却发现了子弹头，他们只好把帕特森叫来，结果在那里找到了大量的残留血迹的痕迹。随着问题越来越严重，里德不得不把调查汤姆的事情，全部告诉帕特森，让帕特森特别生气，怪他们没有提早将这一切告诉她。帕特森确定，找到了血迹是属于梅菲尔的，而那里用了大量的漂白剂，可以断定梅菲尔被杀了，所以她只能建议跟里德他们一起去梅菲尔家里找线索。帕特森发现梅菲尔家里的一幅画变了，而她拿开那幅却发现，画后面藏着保险箱，相信那就是梅菲尔留下的证据，所以她只能跟里德他们一起想保险箱的密码。柯特在木堡上挖了一个大坑，并没有挖出泰勒的尸体，以为父亲所说的话真的是他临终前的胡言，所以开心地跟莎拉一起喝酒庆祝了起来。在拿酒的时候，柯特突然看到了架子上的一件物品，想起他与泰勒去露营的事情，所以他马上开车去那里寻找泰勒的尸体。简跟踪奥斯卡去他处理梅菲尔尸体的地方，结果被奥斯卡给电晕了，等她醒来之时已经被奥斯卡捆绑了起来。奥斯卡说明，为了完成任务，他不得不再次给简注射，再清除一次简的记忆。简一直劝说奥斯卡，让他不要这样对待自己，还说明她记起自己和奥斯卡相爱的事实，可奥斯卡还是不能违背谢培德的指令，必须让任务能够完成。奥斯卡在要给简注射之时，告诉简实情，让她知道她根本就不是泰勒，而那些比对正确的DNA，是他将简的DNA放到了泰勒的档案里。简想起凯德所说的话，认为奥斯卡是杀死马克斯的人，而并非他所说的是凯德所为，奥斯卡只好说明马克斯的死是因为他没有杀死郑超犯的失误，让谢培德下了杀令。简得知了自己想要知道的一切，在奥斯卡准备给她注射之时，袭击了奥斯卡，结果让小木屋着了火。经过激烈地打斗，简将斧头砍在了奥斯卡身上，然后逃出了火海，随后在奥斯卡的车上写下“为了马克斯”，让人以为凶手就是凯德。帕特森从保险箱里拿到了梅菲尔留下的U盘，可U盘的解密只有两次机会，一旦输错文件就将删除。帕特森破解了半天，才知道密码是对不起，可没想到打开的文件让她吓了一大跳，里面是有关白昼计划、俄里翁等的机密文件。柯特找到了泰勒的骸骨，并拿着她随身拿着的娃娃，回简的家里等她，将一切告诉简，想要知道简的真实身份。柯特认为一切是简设的局，要求简坦白所有一切，可简也不知道自己的身份，柯特只好逮捕了她。（本季终）